高光譜成像儀作為精細化的光學測量儀器，可以獲得被測物體的高光譜成像數據，而完整的高光譜成像數據包括圖像數據和輔助數據。圖像數據有三種不同的數據排列格式，輔助數據也根據用途不同而有不同的存在方式，其定義為與光譜定量化、定位及元數據等有關并用于后續處理或數據描述的一系列文件或參數。本文對高光譜成像儀的高光譜數據文件的格式類型做了介紹。

光譜數據文件的格式：

1.BSQ（band sequential，波段順序格式）

每行數據后面緊接著同一波譜波段的下一行數據。這種格式最適于對單個波譜波段中任何部分的空間（X，Y）存取。BSQ格式如下圖中左部分所示。

2.BIP（band interleaved by pixel，波段按像元交叉格式）

在每一行中，每個像元各波段的值按波段次序排列，然后對該行的全部像元按上述順序依次排列，排列完一行的全部像元后，再進行下一行的排列。

也就是說，按BIP格式存儲的圖像按順序存儲第一個像元所有的波段，接著是第二個像元的所有波段，然后是第三個像元的所有波段，等等，交叉存取直到像元總數為止。這種格式為圖像數據波譜（Z）的存取提供最佳性能。

3.BIL（band interleaved by line，波段按行交叉格式）

和BIP格式相區別的是，此種存儲格式是先存儲第一個波段的第一行，接著是第二個波段的第一行，然后是第三個波段的第一行，交叉存取直到波段總數為止。每個波段隨后的行按照類似的方式交叉存取。這種格式提供了空間和波譜處理之間一種折衷方式，它是大多數ENVI處理任務中所推薦的文件格式。BIL格式如下圖中右部分所示。

輔助數據的內容及保存格式：

光譜輔助數據包含了所有與遙感數據相關的信息，如定位信息、定標數據、飛行情況、任務描述、配置參數和數據處理過程等。不同的數據產品包含不同的輔助數據集，數據集的具體內容也是數據產品定義的一部分。輔助數據的內容不同，起到的作用也不同，因此，需要不同的組織形式，當前常用的形式主要有兩種：附加型和獨立型。

1.附加型輔助數據

上述提到的三種標準存儲格式，只是針對光譜數據的存儲而言，有時因為需要添加一些必要的輔助信息而要對這些標準有少許修改，如添加文件頭（尾）和行輔助信息等。

文件頭（尾）：在光譜圖像數據的開始或結束記錄的與數據、飛行等有關的信息，輔助打開文件或標記某些與數據有關的重要參數。

行輔助信息：在上述的標準格式數據中，在每個或者每隔幾個完整的數據結構的前或后添加的輔助信息，如每一行圖像成像時刻的時間、IMU/GPS數據、機上定標信息等，可以是單一信息，也可以是一系統信息，一般用于圖像的各種系統校正和儀器工作狀態的記錄，這些夾雜在圖像數據文件里的輔助信息往往是在數據采集過程中生成和保存的。

2.獨立型輔助數據文件

獨立型輔助數據文件和成像光譜圖像數據文件一般是一一對應的，記錄其對應的光譜圖像數據的相關參數和信息，和其它圖像文件不共用。例如，原始位置姿態數據經處理后生成行方位數據，根據時間對應關系被分配給每一個圖像文件，圖像采集時，傳感器的位置姿態信息和圖像行是嚴格匹配。因此，圖像數據文件和行方位數據文件也是一一對應的。該類輔助數據文件的名稱一般采用和對應成像光譜數據文件名相同但擴展名不同的方式。